Huku Virusi vya Matunda ya Nyanya Brown Rugose inavyoambukiza mimea ya nyanya na pilipili kote ulimwenguni, kampuni za mbegu zinafanya kazi ya kuzaliana nyanya sugu.
Rasilimali nyingi za kijenetiki na jeni zilipatikana kwa wafugaji wa nyanya hata kabla ya kuanzishwa kwa miradi ya mpangilio wa kijinomia ya nyanya. Makusanyo makubwa ya germplasm ya nyanya yameanzishwa kwa muda mrefu katika maeneo kadhaa. Zaidi ya nyongeza 75,000 za nyanya zimehifadhiwa katika benki za jeni kote ulimwenguni. Moja ya kubwa zaidi ni USDA genebank huko Geneva, NY.
Mfuatano wa jenomu ya nyanya ulianzishwa mwaka wa 2005 kama juhudi za kimataifa kati ya nchi 14 na kukamilika mwaka wa 2012. Juhudi hizi zimeharakishwa sana na matumizi ya akili bandia, kujifunza kwa mashine na algoriti za hali ya juu ili kuchanganua idadi kubwa ya data ya kijeni na kifani.
Nyanya Pan-Genome
Watafiti kutoka Taasisi ya Boyce Thompson mnamo 2020 waliunda jenomu ya marejeleo ya hali ya juu kwa nyanya za porini ili kutoa pan-genome ya nyanya kamili na muhimu zaidi. Waligundua sehemu za jenomu ambazo huweka ladha ya matunda, saizi na kukomaa, kustahimili mafadhaiko na ukinzani wa magonjwa. Shukrani kwa sehemu kwa teknolojia za kisasa za mpangilio zinazoweza kusoma vipande virefu sana vya DNA, jenomu ya marejeleo ni kamili na sahihi zaidi kuliko hifadhidata iliyopo.
Teknolojia za zamani za kupanga ambazo husoma vipande vifupi vya DNA hutambua mabadiliko katika kiwango cha msingi mmoja. Hata hivyo, si wazuri katika kutafuta lahaja za miundo kama vile uwekaji, ufutaji, ugeuzaji au urudufishaji wa vipande vikubwa vya DNA.
Mnamo mwaka wa 2019, kikundi cha kimataifa cha watafiti kiliunda jenomu ya pan-nyanya kwa kutumia mlolongo wa jenomu kutoka kwa aina 725 zinazowakilisha filojenetiki na kijiografia. Hifadhidata hii inajumuisha jeni 4,873 ambazo hazipatikani kwenye jenomu asili ya marejeleo. Uchambuzi wa utofauti uliopo/usiopo ulifunua upotevu mkubwa wa jeni na uteuzi mkubwa hasi wa jeni na vikuzaji wakati wa ufugaji na uboreshaji wa nyanya.
Soma nakala kamili kwenye www.seedworld.com.